19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1113 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  35.58 
 
 		 410 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  34.56 
 
 		 2454 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  33 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  31.09 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1248 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 		 566 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  34.02 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  35.23 
 
 		 143 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  24.24 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  28.91 
 
 		 463 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  28.87 
 
 		 146 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  26.39 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  26.21 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  33.78 
 
 		 2542 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  25.9 
 
 		 543 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  24.08 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>