Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Mmc1_3694 |
Symbol | |
ID | 4480974 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Magnetococcus sp. MC-1 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_008576 |
Strand | - |
Start bp | 4637588 |
End bp | 4645111 |
Gene Length | 7524 bp |
Protein Length | 2507 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 55% |
IMG OID | 639724450 |
Product | putative outer membrane adhesin like proteiin |
Protein accession | YP_867585 |
Protein GI | 117926968 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | [TIGR01965] VCBS repeat |
| 

|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 11 |
Fosmid unclonability p-value | 1 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGGCCAAGC ATACGCACAC CTCGTTTCCC ACCCCAACGG TTGTGATGAC CGATGATACA GCGGTGGTTC GTTCTCTTAA TGGACAGGTA CATCTCCTTG ATCCCGCTTA TGTGCAGGAT GGTACCTATC TGCGGGAAGG TGCGGACTTG ATCTTGGTGA AAAGCGATGG CGCTGCGCTG CGGGTGGTGG GCTATTTTGA CCATGTTAAT CTGCCCACCC TTATCTTGCC CCATGGTGGA GCCATCTTGC CAGAGACCAT TCAAGCGGTC TTGGCTACTC AGGGTCACGG GGTGCAGGTA GCGGGCCCCA GCATGGGCGT GACCGAAGCC ATTGGGCAGG TAGCCCAGTT GGCGGGCAAA GTACTGGCGC AGGGGCGGGA TGGGCTTATG CGTATCCTGG ATGAGGGCGA TGAGATTCTG CCCGGTGATA TGCTACGTAC CAGCGGCAAC AGTCTGCTGT TTGTCCTGTT TAAAGATGGG ACAGAGTTTC AGCTTGGCGA GGATGCCCGC GCCATGCTCG ACAACTATAT CTATGATCCG GCCGGTTCCC AAGGTCGATT TGATGCCACC ATTTTACGGG GTATTTTCCG TTATAAAAGC GGGGCTTTAG CCAAGCTTAC CGAAGGTAGC CACACCCTGC TTAAAACCCC TGCGGCCATG ATCCGTGTGC GGGGTTCGGA GGCCGATGGT GAAGTGGGTA GCGATGGGGC GACCACCGTT GTGCATAAAT CGGGTGTGTT TGAGATCTCC GATCCTTTAG GCCAGAACGT GGTTACATTG GATCAGCCCG GCCTTGCTAC CGCCATCAGC TTTGGTCAGG GCCCCGCTCC TGTCTATCAA GCGCCCGCCA ATCTGGTTAG CCGCTTTCAA CAGCAGCTTT CGGCGCAAAG TTTTCAAGAC GCCAAACAGG AGCAGCAAAA CAAGCTGGAA CAAGAGCAGG AGCAGTTGCA GGAGCGCCCT CCAGAGGCTG AACCTGATCC AGAGTTAAAC CAGGGCGAGC CCCCCGAAGG TGAGGGCGAT GGCCGTGGGC CTCCCGAAGG TGAGGGCGAT GGCCGTGAGC CCCCCGAAGG TGAGGGCGAT GGCCGTGAGC CCCCTGAAGG GGAGGGCGAT GACCGCGGAC CCCCTGAAGG GGAGGGCGAT GACCGCGGAC CGCCTGAAGG GGAGGCCAAT GATGAATTCT TCGATAAGCT GTTTGGCAAC GAAGGGGATG ACCCCTTTGC CCTGAATGGT CATGATCCCT TCGAAACAGG GCTGGATGAT GGTTTTGACT TCGGGGGCAA TGAATTCGAA CCCCCCGAGA TAACGCAAAA TAACCCCGAG GATGACTATC TGCCTACCAA CCAAACGGCG GTAACAACCC TAAATTTGGG CAGCTTTGCG GAGTCAGCCA CGGCGGCCAA TCTTACCTTT ACTTTGGAGG ATCTGCGTCA GCTCAGCTCT TATGCCAATG CGGAGATTGA ATTTAACCCC CAATTGGGCT TTTCGGTGGT TAGCCAGGAT AGCTTGGGGA ATGAGGTCTA CCAATATGCG CCTAATGGTC GGTTTGATTA TCTGACTCAA GGTCAGTCGG TAACGGCCAC GGTGGGTACT TTTTACGCCG ATGGTGTGCA GGGCTCGATT GTTGCCACGG TGATTGGGGA CGACTCGGAG TCGTCCCAAT ATTATACCGT AAACGAGGAT AACCCTTTCA GTGGTAACCT AAATTATTAC GTCAACCCCC ACTATGGTAG CCCCATCGCG TTTGAGACCG CCTACAGTGG TCCAGGGTCC CTAACGTTGG ACGCCCAGAC AGGGGCATTC ATCTACAGCC CCAGTTACGC TTTTGGTGAA AACAGCACCC CCAATGGGGA CAGTTATCTC TATGCAGATC AATTTCAGGT GGCGCTGCTC TATAGCGGCA GTGGTGATCC CTTTTACACC TACACCACGG TCTATATGCA GAGTGACTAT GACCCGAGCC TGAACATCAC CACCCTGAGC ATGGATGAGG ATGGCAGCAC AGCCGTCTTT CTGCATGCCA ATGAGCCCAA TGTGGGCACC CATACCCTGC TCTCCCTCTA TGGGGATGCA CAGCATGGTA CGGCCAGCCT AACCAGCTTT GGCACCCTGA GTTATAGCCC CGATCCCGAC TATTTTGGTG TCGAGGTGTT GACCTTGGTT ATGGATGATG GTGAGCGTGA AAGCTATCAA GAGCTGATCA TTACGGTTAA TGGGGTCAAC GATGATCCCG TACTCAGCAC GGCTGCCACC ATCCATGTGA CCGAAGATCA ACCCTACAGT AGCGGCACGG CCACCGCCAC CGATGTGGAT GGGGGCACCC TTACCTTTGC CCTGACCACA CAGGCGGCGC ATGGTTCGGT GAGTTTGGAC AGCATGACCG GGGATTATAC CTATACCCCG GCGGCGGGCT ATTTTGGATC CGACAGTTTT ACCCTGGAGG TAAGCGATGG AAATGGTGGG CTTGACAGTC AGAGTGTGGC GGTTACGGTC GCTGCGGTAA ACGATCACCC GCAACTGACC ACCACCACGA CCATAAGCAC AGCGGAGGAT ACCCCCTACA GTGGCAGTGC GATGGCCAGT GATGGGGAGG GTGATACCCT CTCCTTTAGT GTGATCCAAG GGAGCCATGG TGCGGTGAGC CTGAACAGCT CAACCGGGGA TTATACCTAT ACCCCGGCAG CGGACTATTA TGGCACCGAC AGTTTTACCC TGGAGGTGTC GGATGGCAAT GGGGGTACCG ACAGCCAGAG TGTGACCGTC ACCATTACCG GTGTGAATGA TAGCCCGGTG TTTACCAGCG GTGCCACTTT ATCCACCCAT GAAGATACCC CCTATCATGG TACCATCACC GCCACCGATG TTGAGAATGA CACCCTGACT TATATGCTCT CCAGCCAGCC GAGCCATGGT GCTTTGACCG CATTTGACAG CGGTACAGGC AGCTATAGTT ACACCCCCAC CACCGATTAT TATGGTACCG ATAGCTTTAC CGTAGAGGTG AGCGATGGGC AGGGTGGTAT GCAAAGCCAG ACCATCACCC TAACTGTGGC GGCGCAAAAT GATCTGCCCA CCATCAGCGC GGCCATATCG GTTCTCACAG TGAGTCTGGA TAGCACCAGC TCCAGCTATG CCTATACCGT CGCGGATGTG GATGGCGATA CGCTAGCGGT CTCTTATACC GCTTCTAACG GTGGCAGTGT GGTGCTTTCC AACGCCAGCG GTAGCGGCAC CTTTACCTAC ACCCCGGCTG CGGGTTTTAC CGGGACAGAG ACCATTACCC TCAAAGTGGA CGATCCCACC ACCGCTGCCG ATCCCGGCAC CTATGGTGCC ACCACGCTTA CCGTCACGGT GACGGATGCC ACCGCCCCCT ATACATTGGC ACTCGCCGCT ATGACGGCGG GCAGTGACTA TACCCTGCTT AGTGGTGCCG CTGGGGATGC CTTGGGATAC GCCAGCAGCT ATGTGGATGA CTTTAACAAG GATGGCTTTG GGGACTTGGT GGTGGGGGCC CCCAATGCGG ACAGTGCCGG CAGCGCGTAT GTGCTCTATG GCAGCAGCGA TGGTTTTGGC AGCAGCTTGG ATCTGGGCAC CCTCAATGGT AGCCATGGCT TTTTGTTGCA ATCCCCCACC GGCAGCAACG ATGAGCTGGG TTATGCGGTG ACTGGCACTG GAGATTTTAA CCACGATGGT TACGAAGATG TGATCGTGGG CCTGCCTGGT TACAGCTCTA CGGCGGCGGT AGCGGTGGTT TATGGTCATG CCACCTCCAC CACGGGCACG CTTAATCTAA GCGATCTCGA TGGCAGCAAC GGCGTTTTGA TCCTCGGTGG CAGCTCTACC GCAGGCATGA TGGGTCACGT TCTGCTTGGG GGGTCGGACT ATAATCAGGA TGGGGTGGAT GATCTTTTCC TGGGTTTGTC GGAGCAGGAT ACCGGTTTTG TCGCGGTGGT GTATGGCATG GATGGTGGTT ATGGCACAGC CAGCATGACC ATGGATAACC TGATGCAAGC GGGCCAAGGT AAGATTTTGG TGGGGGAGGC CTATGGGGAT CGTTTTGGTT CGGCCCTAGA AGGGGATATA AACTTCAATA ACGATAACTA CAGCGATCTG ATGGTTGGGG CCAGTGGTGT CAACAGTGGG GCTGGTGCTG TCTATGTGGT GTATGGGGCC ACCGATAATG CCATGGTCAA CACCGTGTAT ATGTCCGATT TAAGCAGCGC CACGGGCTTT ACCCTATATG GTGCCCAAGC GGGGGATGGC TTGGGTAGCT CCATCAGCTA TGTGGGGGAT CTGAACGATG ATGGTTATGA GGATGTGATC ATTGGGGCAC CGGGTGCCAA TGGGGGGCAG GGGGCGGCTT ATGTCCTCTA CGGTAGCGGG AATGTCACGG GCAGCGATCT CTATGTTACC GATCTCGATG GCAGCAATGG TTTTGTGATC AACGGCATGG CGAGCAGTGG GGGGGTAGGC TATTCGGTGC GCATTGCCGG GGATGTGGAT GGGGATGGGT TTGAAGATTT GATAATCGGC GCGCCACAAA GTGTGGGGGT GACGGGTAAT AATGGTGGTC AAGCTTATGT TATTTATGGT CGTAGTGCGG CTGAGAGTGG CTTTGGTGCC TCCCTTAACC TGAGCGATCT GGCCAGCAGC CAAGGTTTTA TGCTCAAGGG TGTGGACAGC AATGATGGGT TTGGCGCCTC GGTGAGTGGT CTGCTGGATG TCAATGGGGA TGGTTATTTT GATTTGGTGG TGGGCGCTCC TGCGGCGACC GCCAGCACCG CCGGTGATGT GGGGGGTGAG GCCTATATTA TCTATGGCAA GGATTTCCGG GGGCGCATGG ATAACTCCTA TACGGCGGGG GATGATGTGA TCACCGCGCC TGGGGCCGAT ACCGATATAA TCCGGCTGGA TGGTGGCGCG GGCAATGACA CCATAACCGG CAGTGCCAAT GGCGATCTCA TCATTGGTGG GTTGGGTCAT GATACCCTCT ATGCCGGTAG TGGTAGCGAT ACCATTTATG CCGGGGCAGG CAACGATATA ATCTACCTTG ATGATGTGCA GAGTAGCGAT AGTGACCAAA TTTGGGGTGG GGCGGGGGTG GATAAGGTTG TGATCAATAG CGCCGCTGGG GTTACGCTGG ACTATAGCAA CGGTGGCGAT CCCATAGAGC TCTCTTCGGT GGAGTGGCTG GATCTGGAAA ATGGTGGGAC CGATCAGCTA ACCATCACCG CTTGGGCGTT GCGGGATGCC TCCTCCAGCT TGGGTTACAG TATGGTCACG GGGGATAGTG GCGACACCAT AAGCGCCCCC AGTTGGGATG GGCAGTGGTA TTACCATACC TCGGGTGTTT ATCAGGATCC CATCACCGGC AGTGGGGTGA AAACCTTTAA TATTTACTAC AACCTTTCCG GCAGTAGCGA TACGACGACC AACGCCATTC TCGCGGTGGA GAGTGATGTG GATCAGAGCG GGCTGAACGC CATCAACATC TCTTTCCGTT CGGTAGGTTA TCTGGAGAGC AATACGGGGG CGGTATTAAA CGGTGCCACT GCGGGTGATT TGACGGGGCG TCAAACCAAG GGTATTGGGG ATATTAATGG CGATGGTTAT GGGGATTTTG CCATAAGTGC CCATGCTGCC GACCCCAATG GGGTCAGCGC CGCCGGTCAG GTCTATGTGG TGTATGGAAC CAGCGATGGG TTTGGTGAAA GTTTTGAGCT GAGCAGCCTC AATGGTGCCA ATGGTTTTGT GGTGGAGGGG GATACGGCGG GGTTAAAGCT GGGTTACACC ATCAGCGGTG CCGGGGATAT TAACGCCGAT GGTTATGCCG ATTTTGTGAT TGGCAACAAT CAATCGGGGG ATGCCGGTCA TGCCTATGTG ATTTTGGGCA GTGGTACCCG CAACAGTGCC ACCCTGAATA TCGGTTCGTT ATCCAGCAGT GAGGGTTTTA CCATCAGCCG TAGCAGCGGT GATAGCCCCC TGAGCACCCG TGGTGGGGGT GACATCAACG GCGATGGTTA TAGCGATATT GTGCTGGCCG ACAGCAATGC GGACATTGAT CTGAACAGTG ATATGGTCGA TGAGAGCAAT GTGGGGGCGG TCTATGTCAT CTATGGCCGT GCCAATGTGG GCGATGTGAG CCTCACCGAT CTGGACGGCA GCAACGGTTT TATCGTGACC GGGGATGCCG CTGGAGCCGA ATTTGGTGTT TCAGCCACGG CCCATGGTGA TCTGAACGGC GATTTTATGG ATGACCTGAT CATTGGTGCT GGGGATAGTT TGCATAGCGC AGCGGGACAG CTGTGGACCG TGTGGGGCAG TCAATCTTTA AATACGGCCA GCATCGGGGT GGATACGTTG CGCGACAGCA GCAGGGCGTT TCAGATCTAC AACAGCCAGG GGGGGGATCA GTTTGCCCAT AAGCTCGCGT ATGCTGGAGA TCTAAACGGC GATGGTTATA GCGATATGGT GATTGGCTAC GCCGGTGCCA ACAGCGCCCA AGGTGGGGCG TTGATTATCT ATGGTCGCGA CGCCATGGCA ACCAACTTTA ATGGGGCACT TACCGTGAGC TCAGCGCTCT CCATGGGCAA TGTGGTGGCC TTGGATGGCT TTACCTCGGG CAGTTACTGG GGGGATCGGG TGCGGGGGGT TGGGGATCTC AATGGTGATG GCTATGATGA TCTCTCGATT GGTTCACGTC TCGTCAATGG CACGGGAGCG ACCGCCATCC TTTATGGTGG TGATACGACC CTCTCGTTGA CCAGCAACGC TTTGGCGGCG GTGAATGGCA GCAACGGGTT TATCGTCTAC GGCAATCAGG CTGGTGGTCA GTTTATGGTG GATGGTTCGG CGCTGGGGGA TGTCAATGGT GATGGTTTTG ATGATCTCAT TGCCGGGGCC AATATGGTGG ATGTGAATGG TGGTGCGGAT ACTGGGGTTG CCTATCTTTT CTATGGCCAG GACTATAGCA ATATTGGTGC GATTTTGGGC AGTCCCATCA GCAGCGGTAC GTTGACCGGT ACCTCGGGCA CGGATGCCAT CCACGGTAAT ATCCAGAGTG AGATCATTGA TGGTGGGGCG GGGGCGGATG CCCTCTATGG TGGGGGTGGC AACGATATTT TGATCTACGA TGATCTGGAT TATTATGTGG ATGGTGGGGC CGGCTCGGAT GCCATTGTGG TGAGTGGGGC CGGGATAACA ATTGGTGGTG CCACGACCCA GACCGGCCAT GGGGATGTGC ATAATATCGA GGCGGTGGAT CTGACCGGAA CCGGCGATAA CACCCTATAC TTGGATCTTA ATCAAGTATT GGATATAACC GACAGCAAGC AGACCCTACT GGTTTATGGC AACAGTGGCG ATACCCTGTA TATGAATGAC TTCAATAGCT GGAATCTGGC CACCACGGGC TCCATGACCA ACCCCACCAG CAGCGGTAAT ACCATCAACT ACAATCTCTA TACCAATGGT GTGGCCAAGC TGTTGGTGGA TCAGGATATA AACTTTTTGA ACAGTGTGCT TTAG
|
Protein sequence | MAKHTHTSFP TPTVVMTDDT AVVRSLNGQV HLLDPAYVQD GTYLREGADL ILVKSDGAAL RVVGYFDHVN LPTLILPHGG AILPETIQAV LATQGHGVQV AGPSMGVTEA IGQVAQLAGK VLAQGRDGLM RILDEGDEIL PGDMLRTSGN SLLFVLFKDG TEFQLGEDAR AMLDNYIYDP AGSQGRFDAT ILRGIFRYKS GALAKLTEGS HTLLKTPAAM IRVRGSEADG EVGSDGATTV VHKSGVFEIS DPLGQNVVTL DQPGLATAIS FGQGPAPVYQ APANLVSRFQ QQLSAQSFQD AKQEQQNKLE QEQEQLQERP PEAEPDPELN QGEPPEGEGD GRGPPEGEGD GREPPEGEGD GREPPEGEGD DRGPPEGEGD DRGPPEGEAN DEFFDKLFGN EGDDPFALNG HDPFETGLDD GFDFGGNEFE PPEITQNNPE DDYLPTNQTA VTTLNLGSFA ESATAANLTF TLEDLRQLSS YANAEIEFNP QLGFSVVSQD SLGNEVYQYA PNGRFDYLTQ GQSVTATVGT FYADGVQGSI VATVIGDDSE SSQYYTVNED NPFSGNLNYY VNPHYGSPIA FETAYSGPGS LTLDAQTGAF IYSPSYAFGE NSTPNGDSYL YADQFQVALL YSGSGDPFYT YTTVYMQSDY DPSLNITTLS MDEDGSTAVF LHANEPNVGT HTLLSLYGDA QHGTASLTSF GTLSYSPDPD YFGVEVLTLV MDDGERESYQ ELIITVNGVN DDPVLSTAAT IHVTEDQPYS SGTATATDVD GGTLTFALTT QAAHGSVSLD SMTGDYTYTP AAGYFGSDSF TLEVSDGNGG LDSQSVAVTV AAVNDHPQLT TTTTISTAED TPYSGSAMAS DGEGDTLSFS VIQGSHGAVS LNSSTGDYTY TPAADYYGTD SFTLEVSDGN GGTDSQSVTV TITGVNDSPV FTSGATLSTH EDTPYHGTIT ATDVENDTLT YMLSSQPSHG ALTAFDSGTG SYSYTPTTDY YGTDSFTVEV SDGQGGMQSQ TITLTVAAQN DLPTISAAIS VLTVSLDSTS SSYAYTVADV DGDTLAVSYT ASNGGSVVLS NASGSGTFTY TPAAGFTGTE TITLKVDDPT TAADPGTYGA TTLTVTVTDA TAPYTLALAA MTAGSDYTLL SGAAGDALGY ASSYVDDFNK DGFGDLVVGA PNADSAGSAY VLYGSSDGFG SSLDLGTLNG SHGFLLQSPT GSNDELGYAV TGTGDFNHDG YEDVIVGLPG YSSTAAVAVV YGHATSTTGT LNLSDLDGSN GVLILGGSST AGMMGHVLLG GSDYNQDGVD DLFLGLSEQD TGFVAVVYGM DGGYGTASMT MDNLMQAGQG KILVGEAYGD RFGSALEGDI NFNNDNYSDL MVGASGVNSG AGAVYVVYGA TDNAMVNTVY MSDLSSATGF TLYGAQAGDG LGSSISYVGD LNDDGYEDVI IGAPGANGGQ GAAYVLYGSG NVTGSDLYVT DLDGSNGFVI NGMASSGGVG YSVRIAGDVD GDGFEDLIIG APQSVGVTGN NGGQAYVIYG RSAAESGFGA SLNLSDLASS QGFMLKGVDS NDGFGASVSG LLDVNGDGYF DLVVGAPAAT ASTAGDVGGE AYIIYGKDFR GRMDNSYTAG DDVITAPGAD TDIIRLDGGA GNDTITGSAN GDLIIGGLGH DTLYAGSGSD TIYAGAGNDI IYLDDVQSSD SDQIWGGAGV DKVVINSAAG VTLDYSNGGD PIELSSVEWL DLENGGTDQL TITAWALRDA SSSLGYSMVT GDSGDTISAP SWDGQWYYHT SGVYQDPITG SGVKTFNIYY NLSGSSDTTT NAILAVESDV DQSGLNAINI SFRSVGYLES NTGAVLNGAT AGDLTGRQTK GIGDINGDGY GDFAISAHAA DPNGVSAAGQ VYVVYGTSDG FGESFELSSL NGANGFVVEG DTAGLKLGYT ISGAGDINAD GYADFVIGNN QSGDAGHAYV ILGSGTRNSA TLNIGSLSSS EGFTISRSSG DSPLSTRGGG DINGDGYSDI VLADSNADID LNSDMVDESN VGAVYVIYGR ANVGDVSLTD LDGSNGFIVT GDAAGAEFGV SATAHGDLNG DFMDDLIIGA GDSLHSAAGQ LWTVWGSQSL NTASIGVDTL RDSSRAFQIY NSQGGDQFAH KLAYAGDLNG DGYSDMVIGY AGANSAQGGA LIIYGRDAMA TNFNGALTVS SALSMGNVVA LDGFTSGSYW GDRVRGVGDL NGDGYDDLSI GSRLVNGTGA TAILYGGDTT LSLTSNALAA VNGSNGFIVY GNQAGGQFMV DGSALGDVNG DGFDDLIAGA NMVDVNGGAD TGVAYLFYGQ DYSNIGAILG SPISSGTLTG TSGTDAIHGN IQSEIIDGGA GADALYGGGG NDILIYDDLD YYVDGGAGSD AIVVSGAGIT IGGATTQTGH GDVHNIEAVD LTGTGDNTLY LDLNQVLDIT DSKQTLLVYG NSGDTLYMND FNSWNLATTG SMTNPTSSGN TINYNLYTNG VAKLLVDQDI NFLNSVL
|
| |