27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1759 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1213    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  63.34 
 
 
556 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  50.82 
 
 
581 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  49.92 
 
 
576 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  49.75 
 
 
573 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  47.76 
 
 
335 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  33.75 
 
 
300 aa  90.9  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  36 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  34.68 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  40.54 
 
 
143 aa  61.6  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  29.23 
 
 
376 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  29.15 
 
 
294 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  32.22 
 
 
153 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  32.98 
 
 
542 aa  57.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  25.85 
 
 
2039 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 
2507 aa  54.7  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  25.16 
 
 
800 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  31.52 
 
 
1248 aa  53.5  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  29 
 
 
143 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  27.55 
 
 
147 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  31.31 
 
 
164 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  22.69 
 
 
282 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  25.71 
 
 
154 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  26.95 
 
 
348 aa  44.3  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  25.29 
 
 
312 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>