26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3662 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  82.8 
 
 
352 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  60.7 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  31.43 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  34.11 
 
 
153 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  32.26 
 
 
581 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2533  hypothetical protein  36.36 
 
 
573 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  31.9 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  34.38 
 
 
556 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  33.64 
 
 
576 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  35.51 
 
 
602 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.83 
 
 
2507 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  31.06 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  29.31 
 
 
800 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  27.73 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  27.45 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2346  hypothetical protein  26.03 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  31.34 
 
 
2136 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  29.73 
 
 
2039 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  27.19 
 
 
155 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  28.33 
 
 
542 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.93 
 
 
2272 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.26 
 
 
2179 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>