35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1070 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  93.43 
 
 		 333 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 		 484 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  33.1 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  35.39 
 
 		 454 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  35.39 
 
 		 448 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  35.39 
 
 		 454 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  35.39 
 
 		 454 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  35.39 
 
 		 448 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  35.39 
 
 		 448 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  34.51 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  34.98 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  34.98 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  29.63 
 
 		 568 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  30.36 
 
 		 453 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  30.36 
 
 		 453 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  31.65 
 
 		 446 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 		 453 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 		 453 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  28.02 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  26.46 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  26.33 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  27.39 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  28.42 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  27.06 
 
 		 591 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  24.17 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3662  hypothetical protein  27.73 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  27.7 
 
 		 566 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4566  hypothetical protein  34.51 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  30.09 
 
 		 543 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1762  hypothetical protein  27.19 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426629  normal  0.0904839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  27.32 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>