61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5417 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 591 aa  1165    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  30.59 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  30.22 
 
 		 559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  31.61 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  28.79 
 
 		 559 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  31.17 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  31.67 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  30.47 
 
 		 558 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  31.47 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  31.47 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  27.03 
 
 		 556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  33.18 
 
 		 453 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  30.95 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  30.82 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  30.95 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  30.82 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  30.82 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  30.95 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  31.24 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  30.82 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  32.27 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  32.27 
 
 		 453 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  32.27 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  26.84 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  30.88 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.36 
 
 		 484 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  29.25 
 
 		 463 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  27.68 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  34.12 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  28.24 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  26.88 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  55.32 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  25.21 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  43.94 
 
 		 96 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 219 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  38.55 
 
 		 251 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  27.45 
 
 		 717 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  29.31 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  43.94 
 
 		 96 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 1334 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  31.87 
 
 		 238 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 410 aa  50.4  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  44.68 
 
 		 190 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  26.39 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.68 
 
 		 954 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  36.14 
 
 		 237 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  33.93 
 
 		 1381 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  51.06 
 
 		 256 aa  47.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.19 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  25.6 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.04 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 318 aa  45.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2538  hypothetical protein  27.36 
 
 		 142 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.828512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.61 
 
 		 327 aa  44.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  30.95 
 
 		 329 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.62 
 
 		 320 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  38.78 
 
 		 659 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  30.81 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 229 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  25 
 
 		 2039 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>