More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 328 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  87.84 
 
 		 329 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  43.21 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  42.6 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  40.99 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  34.19 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  36.79 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  36.42 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  35.08 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  34.35 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  38.2 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.41 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  35.96 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.72 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  32.17 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  34.52 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  34.37 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  37.58 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.75 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  36.91 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  35.4 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  37.13 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.12 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  37.13 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.42 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  35.37 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  33.03 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.6 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  37.01 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  34.42 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  31.45 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.01 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.19 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  35.81 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  32.31 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.27 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  34.14 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  32.93 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  34.44 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  32.54 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  41.46 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  41.46 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  41.46 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  41.46 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  33.43 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.1 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  39.25 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  41.46 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  34.73 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  33.14 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  40.19 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  35.13 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  32.54 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  33.44 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  33.44 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  33.24 
 
 		 357 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  34.38 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  34.63 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.3 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  33.13 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  34.62 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  29.78 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  35.85 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  34.26 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.88 
 
 		 374 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  32.29 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  33.44 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  31.86 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  32.54 
 
 		 374 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  32.93 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.98 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  35.24 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  32.26 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.77 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  35.84 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  35.23 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  38.81 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  29.06 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  33.82 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30.51 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.33 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  35.98 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  33.23 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>