More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1205 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  94.95 
 
 		 317 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  52.24 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  51.28 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  48.85 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  48.88 
 
 		 314 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  48.56 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  48.56 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  47.77 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  49.03 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  47.44 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  50.16 
 
 		 334 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  48.87 
 
 		 313 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  43.83 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  47.65 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  47.65 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  47.65 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  47.42 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  45.54 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  44.2 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  44.09 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  41.59 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  43.79 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  48.75 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  48.75 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  48.4 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  41.9 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  37.66 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  43.63 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  41.49 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  41.31 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  40.33 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  41.59 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  41.35 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  37.23 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  41.14 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  42.39 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  41.64 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  38.51 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  38.71 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  43.09 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  39.62 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  39.74 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  42.5 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  38.94 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  36.68 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  37.13 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  38.39 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  37.85 
 
 		 330 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  39.81 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  38.83 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  38.01 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  37.74 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  39.75 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  37.81 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  38.49 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  33.55 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  40.32 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  38.49 
 
 		 340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  41.16 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  40 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  37.04 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  37.34 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  37.01 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  36.28 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  36.79 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  36.19 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  38.21 
 
 		 340 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  40.19 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  34.09 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  35.96 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  36.77 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  38.82 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  36.28 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  35.37 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  34.09 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  34.09 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  33.54 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  34.09 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  34.09 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  36.45 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  36.45 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  36.08 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  33.77 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  36.72 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  41.28 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  36.68 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  37.15 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  35.62 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  34.98 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  33.88 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  34.42 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.11 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  35.39 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  35.17 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>