More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4160 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  97.26 
 
 
329 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  96.96 
 
 
329 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
329 aa  680    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  40.13 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  38.53 
 
 
327 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  39.88 
 
 
320 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  38.44 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  39.75 
 
 
317 aa  195  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  39.01 
 
 
321 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  37.03 
 
 
311 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  36.96 
 
 
328 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  35.91 
 
 
313 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  38.56 
 
 
327 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  36.6 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  38.2 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  36.45 
 
 
314 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  36.89 
 
 
317 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  34.59 
 
 
321 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  35.96 
 
 
318 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  34.73 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  36.16 
 
 
319 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  34.28 
 
 
327 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  35.06 
 
 
313 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  36.45 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.58 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  34.29 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  34.92 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  35.29 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  36.19 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  37.13 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  36.77 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  36.83 
 
 
318 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  34.07 
 
 
325 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  36.06 
 
 
356 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  35.9 
 
 
315 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 
353 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  35.91 
 
 
328 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  34.52 
 
 
317 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  34.52 
 
 
317 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  34.52 
 
 
317 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  34.52 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  33.96 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  34.62 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  33.98 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  35.42 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  35.42 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  34.19 
 
 
317 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  33.44 
 
 
334 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  33.44 
 
 
334 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  36.33 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  34.8 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  33.44 
 
 
334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  35.48 
 
 
318 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  32.91 
 
 
327 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  34.47 
 
 
315 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  35.03 
 
 
323 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  35.53 
 
 
316 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  32.25 
 
 
318 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  36.07 
 
 
307 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  31.19 
 
 
326 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 
327 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  39.29 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  39.29 
 
 
314 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  39.29 
 
 
314 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  33.76 
 
 
321 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  32.28 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  34.39 
 
 
323 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 
318 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  35.6 
 
 
328 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 
318 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 
316 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 
318 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  33.86 
 
 
316 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  32.69 
 
 
323 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  31.03 
 
 
320 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 
318 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  35.48 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.67 
 
 
340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.59 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
308 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  31.72 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  37.5 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  32.79 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  32.28 
 
 
315 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  32.69 
 
 
308 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  33.98 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  28.98 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  32.68 
 
 
325 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.51 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  31.42 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 
328 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  30.74 
 
 
314 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 
314 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  31.56 
 
 
325 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 
320 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 
317 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>