298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4232 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  97.26 
 
 		 329 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  96.66 
 
 		 329 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 329 aa  679    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  39.81 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  37.61 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  39.23 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  37.81 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  36.39 
 
 		 311 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  39.18 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  38.34 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  35.91 
 
 		 313 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  37.11 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  37.93 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  35.95 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  35.39 
 
 		 313 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  35.67 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  35.51 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  35.6 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  34.43 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  37.19 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  33.96 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  36.57 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  35.44 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  36.13 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  34.3 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  34.6 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  36.51 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  35.13 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  36.48 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  36.77 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  36.45 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  35.15 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  35.48 
 
 		 315 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  35.23 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  36.33 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  34.29 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  32.59 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  34.72 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  34.08 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  34.72 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  33.33 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  34.91 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  32.49 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  32.49 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  34.17 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  32.9 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  32.9 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  32.9 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  32.49 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  32.9 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  31.19 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  32.58 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  32.25 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  35.74 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  34.39 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  37.95 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  37.95 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  32.69 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  37.95 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  34.73 
 
 		 328 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  32.58 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  33.54 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  35.48 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  32.36 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  31.75 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  30.96 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.33 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.95 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  31.01 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  36.54 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  30.99 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  32.36 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.73 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  32.13 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  32.68 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  29.15 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  33.33 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  31.42 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  30.74 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  31.29 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  30.74 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  31.56 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.55 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>