More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1360 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  100 
 
 
330 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  100 
 
 
330 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  88.33 
 
 
328 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  77.13 
 
 
328 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  64.33 
 
 
334 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  63.19 
 
 
334 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  63.19 
 
 
334 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  63.19 
 
 
334 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  63.64 
 
 
314 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  63.64 
 
 
314 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  63.29 
 
 
314 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  49.07 
 
 
317 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  48.92 
 
 
317 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  50.65 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  46.86 
 
 
327 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  40.73 
 
 
326 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  40.51 
 
 
327 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  42.68 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  44.95 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  41.46 
 
 
320 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  38.04 
 
 
329 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  41.32 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  38.68 
 
 
319 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  38.79 
 
 
323 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  40.89 
 
 
308 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  43.03 
 
 
316 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  42.14 
 
 
318 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  42.68 
 
 
316 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  37.22 
 
 
320 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  40.26 
 
 
327 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  40.49 
 
 
321 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  41.23 
 
 
332 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  42.09 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  39.25 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  39.38 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  41.46 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  40.06 
 
 
328 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  40.57 
 
 
327 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  40.31 
 
 
318 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  39.94 
 
 
328 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  38.63 
 
 
353 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  44.94 
 
 
327 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  38.64 
 
 
330 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  41.08 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  40.19 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  40.69 
 
 
313 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  42.86 
 
 
340 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  39.81 
 
 
313 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  39.87 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  36.05 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  37.93 
 
 
313 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  36.86 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  40.57 
 
 
311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  37.1 
 
 
317 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  37.1 
 
 
317 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  37.1 
 
 
317 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  41.7 
 
 
317 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  37.1 
 
 
317 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  37.1 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  38.51 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  39.31 
 
 
313 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  38.08 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  39.45 
 
 
318 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  41.18 
 
 
316 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  41.16 
 
 
340 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  39.06 
 
 
321 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  35.92 
 
 
311 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  36.81 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  39.1 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  34.82 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  36.46 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  36.46 
 
 
329 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  35.76 
 
 
329 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  36.22 
 
 
332 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  37.72 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  34.19 
 
 
318 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 
318 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  37.3 
 
 
325 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  33.54 
 
 
321 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  36.91 
 
 
315 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  36.19 
 
 
323 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  36.74 
 
 
323 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  36.89 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  35.06 
 
 
324 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  35.6 
 
 
317 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 
318 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  37.27 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 
316 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  32.9 
 
 
318 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
318 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 
315 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1340  hypothetical protein  81.37 
 
 
325 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470908  normal  0.0500322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  34.62 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  36.58 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.48 
 
 
317 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  34.85 
 
 
323 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  37.46 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.02 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>