More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0419 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  100 
 
 
314 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  99.68 
 
 
314 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  99.68 
 
 
314 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  99.66 
 
 
334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  98.04 
 
 
334 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  98.04 
 
 
334 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  86.2 
 
 
334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  63.39 
 
 
328 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  63.95 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  63.95 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  65.42 
 
 
328 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  49.48 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  50.86 
 
 
314 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  47.74 
 
 
317 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  41.38 
 
 
329 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  42.09 
 
 
326 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  44.29 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  44.93 
 
 
332 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  43.92 
 
 
328 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  44.67 
 
 
320 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  41.38 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  43.14 
 
 
327 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  43.1 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  40.69 
 
 
305 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  44.03 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  37.06 
 
 
333 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  42.42 
 
 
318 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  40.82 
 
 
307 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  38.83 
 
 
319 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  42.27 
 
 
313 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  42 
 
 
328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  42.18 
 
 
321 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  36.93 
 
 
311 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  41.77 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  42.56 
 
 
308 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  41.27 
 
 
330 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  44.25 
 
 
321 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  36.58 
 
 
320 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  39.4 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  40.34 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  41.05 
 
 
317 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  39.74 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  39.33 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  37.18 
 
 
311 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  42.86 
 
 
316 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  36.67 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  41.44 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  40.26 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  40.14 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  45.12 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  39.04 
 
 
336 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  41.64 
 
 
316 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  40.27 
 
 
314 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  40.91 
 
 
316 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  37.7 
 
 
318 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  37.7 
 
 
318 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  34.55 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  38.33 
 
 
321 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  39.26 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  38.62 
 
 
323 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  38.49 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  37.58 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 
329 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  32.89 
 
 
317 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 
317 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  35.47 
 
 
327 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  32.89 
 
 
317 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  39.58 
 
 
340 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  32.56 
 
 
317 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  32.69 
 
 
317 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  38.79 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  37.33 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  36.98 
 
 
315 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  34.8 
 
 
318 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 
318 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  34.65 
 
 
318 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  37.17 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  33.77 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  33.22 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  35.79 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  35.39 
 
 
318 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 
318 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  35.86 
 
 
317 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  34.71 
 
 
325 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 
318 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  37.41 
 
 
323 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  35.76 
 
 
313 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  34.98 
 
 
332 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  34.92 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  31.29 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  37.85 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  35.12 
 
 
318 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  37.76 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  38.1 
 
 
314 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  33.33 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 
328 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.89 
 
 
315 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  38.46 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>