287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1208 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  100 
 
 
325 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  89.23 
 
 
325 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  56.37 
 
 
305 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  55.24 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  54.29 
 
 
308 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  51.6 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  51.28 
 
 
317 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  40.51 
 
 
326 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  40.89 
 
 
314 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  41.9 
 
 
328 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  42.15 
 
 
332 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  43.26 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  41.9 
 
 
313 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  40.42 
 
 
328 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  41.77 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  41.77 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  40.06 
 
 
316 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  40.37 
 
 
334 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  40.62 
 
 
328 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  38.73 
 
 
318 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  40.52 
 
 
307 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  40.13 
 
 
316 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  37.83 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  39.39 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  38.73 
 
 
327 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  40.06 
 
 
313 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  38.99 
 
 
316 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  39.94 
 
 
334 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  39.94 
 
 
334 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  39.94 
 
 
334 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  34.85 
 
 
325 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  38.2 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  38.61 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  35.02 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  37.54 
 
 
318 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  34.59 
 
 
329 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  35.92 
 
 
327 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  35.99 
 
 
333 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  36.76 
 
 
318 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  40.56 
 
 
314 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  40.56 
 
 
314 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.82 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  40.21 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  36.18 
 
 
311 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  36.74 
 
 
327 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  38.22 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  35.94 
 
 
321 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  36.94 
 
 
313 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  35.17 
 
 
319 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  37.5 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  40.14 
 
 
317 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  36.89 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  36.91 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 
353 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  37.39 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  36.13 
 
 
323 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 
318 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  33.44 
 
 
321 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  37.66 
 
 
315 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  35 
 
 
318 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  34.67 
 
 
318 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  36.75 
 
 
317 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  36.83 
 
 
318 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  37.42 
 
 
317 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  35.87 
 
 
320 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  35.46 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  36.04 
 
 
317 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  36.04 
 
 
317 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  36.04 
 
 
317 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  36.36 
 
 
321 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  36.04 
 
 
317 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  35.84 
 
 
327 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  36.48 
 
 
314 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  34.83 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  37.58 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  33.84 
 
 
336 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  36.59 
 
 
356 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 
318 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 
323 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  32.27 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  35.76 
 
 
323 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 
315 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  34.04 
 
 
323 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 
329 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 
329 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.57 
 
 
317 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  32.27 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 
315 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  36.11 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  33.23 
 
 
320 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.21 
 
 
315 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  35.59 
 
 
314 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  35.23 
 
 
314 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>