249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4300 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  100 
 
 
313 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  28.88 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  27.92 
 
 
321 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  29.64 
 
 
318 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 
318 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 
318 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 
329 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  28.75 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  26.52 
 
 
316 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  26.63 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  30.13 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  28.16 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  28.3 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  29.94 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  27.66 
 
 
328 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  26.2 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  29.87 
 
 
308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  28.39 
 
 
316 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  26.01 
 
 
318 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  27.39 
 
 
305 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  29.45 
 
 
330 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  29.45 
 
 
330 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  28.79 
 
 
315 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 
320 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  28.34 
 
 
327 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  26.52 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  28.88 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  27.36 
 
 
313 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  28.96 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  29.26 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  27.45 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  26.69 
 
 
333 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  26.28 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  28.39 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  27.99 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  28.57 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  25.89 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 
314 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  27.13 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.28 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  26.99 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  29.79 
 
 
314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  28.95 
 
 
323 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 
325 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  27.55 
 
 
328 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  29 
 
 
328 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  25.55 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  24.92 
 
 
320 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0206  anti-FecI sigma factor, FecR  27.16 
 
 
322 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.74 
 
 
317 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.99 
 
 
311 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  26.98 
 
 
327 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  25.9 
 
 
353 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  25.71 
 
 
317 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  26.19 
 
 
314 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  27.19 
 
 
336 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  25.39 
 
 
317 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  25.39 
 
 
317 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  27.56 
 
 
318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.04 
 
 
330 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 
318 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  25.39 
 
 
317 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  26.86 
 
 
317 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  28.43 
 
 
325 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  26.56 
 
 
334 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  25.08 
 
 
317 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  27.39 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  27.39 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  27.39 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  28.12 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  25.16 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  26.38 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  26.54 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  27.82 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  26.32 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  30.63 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  30.63 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  30.63 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  26.99 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  23.08 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  26.71 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  25.71 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  26.05 
 
 
318 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  25.62 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  25.75 
 
 
323 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  28.31 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  23.33 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  25.25 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1827  anti-FecI sigma factor, FecR  24.3 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  0.321003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  27.01 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>