More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0910 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 320 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  88.75 
 
 		 328 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  89.06 
 
 		 320 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  80.94 
 
 		 320 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  51.88 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  44.25 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  37.46 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  36.91 
 
 		 327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  30.4 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  35.48 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30.37 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  32.12 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.33 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.87 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  32.23 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  35.48 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  32.8 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  41.87 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  41.87 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  33.9 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  35.74 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  31.79 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.8 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  35.69 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  36.71 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  34.64 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  33.22 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  34.06 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  29.94 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.62 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  35.71 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.73 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.37 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  30.92 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  35.56 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  35.92 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  33.55 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.49 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.22 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  38.43 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  31.6 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  33.55 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.74 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.38 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.51 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  33.87 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  34.98 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  24.73 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  33.66 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.44 
 
 		 264 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  31.21 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  32.27 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  34.89 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.95 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  33.87 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.67 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  35.07 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.63 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.46 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  32.01 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  33.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.81 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  39.8 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.9 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  29.04 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  27.59 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  31.62 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  31.41 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.05 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.45 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  34.11 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  32.79 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.49 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>