More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3785 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  100 
 
 
327 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  51.88 
 
 
320 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  55.31 
 
 
320 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  51.56 
 
 
328 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  50.62 
 
 
320 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  45.59 
 
 
357 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  35.33 
 
 
333 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  36 
 
 
331 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  37.1 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  36.45 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  35 
 
 
331 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  33.85 
 
 
342 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 
335 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  38.03 
 
 
328 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  43.58 
 
 
268 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 
335 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  38.36 
 
 
277 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  33.44 
 
 
337 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  32.7 
 
 
336 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.93 
 
 
345 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  44.55 
 
 
280 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  29.06 
 
 
396 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  35.29 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  33.54 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  35.39 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.41 
 
 
320 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  33.95 
 
 
375 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  32.08 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.79 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  33.11 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  30.97 
 
 
368 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  34.76 
 
 
339 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  33.55 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  37.22 
 
 
274 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.91 
 
 
336 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  34.39 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.44 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  27.49 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.76 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  32.58 
 
 
330 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.84 
 
 
316 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.15 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  38.14 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.79 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  33.44 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  37.05 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.56 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  34.63 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  35.69 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  33.66 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  32.58 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  33.95 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  38.35 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  29.38 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  31.76 
 
 
301 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.26 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.61 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 
318 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 
342 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 
318 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  29.94 
 
 
342 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32.77 
 
 
338 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  30.35 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  32.67 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  32.19 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  33.33 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
313 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  27.76 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.31 
 
 
334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  37.73 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 
320 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  26.69 
 
 
319 aa  119  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.2 
 
 
264 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.26 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 
344 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  32.76 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  31.01 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  33.22 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  26.8 
 
 
373 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  32.14 
 
 
332 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  33.13 
 
 
331 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 
315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.9 
 
 
328 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.11 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  32.8 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  26.86 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.07 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  31.64 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>