More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2775 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 314 aa  631  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  39.74 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  36.59 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  37.58 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  37.58 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  37.54 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  38.82 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  37.8 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  36.49 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  36.27 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.93 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  39.66 
 
 		 329 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  37.9 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  35.14 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  35.76 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  34.25 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  33.02 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.12 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.84 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  35.55 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  34.11 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  31.79 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  30.55 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  31.55 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.33 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  31.27 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.23 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.39 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.27 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  33.87 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  29.87 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.89 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.19 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  31.66 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.71 
 
 		 383 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  32.13 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  37.8 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  35.65 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  31.83 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  40.4 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  29.21 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.46 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  35.46 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  29.03 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  29.49 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  30.52 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.09 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.53 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  32.09 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.15 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.87 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  29.87 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  31.21 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  27.19 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  29.71 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  38.5 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  30.3 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.05 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  30.33 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  29.33 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  31.67 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  28.25 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.76 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.67 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  36.67 
 
 		 333 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.85 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  30.82 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.18 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.38 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  27.53 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.31 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  29.74 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  31.87 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>