More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4120 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  100 
 
 
324 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  99.38 
 
 
324 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  40.26 
 
 
326 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  38.63 
 
 
329 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  39.56 
 
 
326 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  39.56 
 
 
326 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  38.91 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  40.3 
 
 
331 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  37.04 
 
 
328 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  38.71 
 
 
328 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  38.6 
 
 
331 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  35.31 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  33.96 
 
 
317 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  34.85 
 
 
337 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.57 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  33.54 
 
 
327 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 
307 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 
329 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  35.43 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.89 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.13 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  35.8 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  34.08 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  33.12 
 
 
329 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  33.04 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  31.37 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 
321 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  32.91 
 
 
317 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  31.99 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  33.7 
 
 
308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32.39 
 
 
338 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.93 
 
 
316 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 
309 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  32.62 
 
 
320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.18 
 
 
324 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.11 
 
 
315 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  29.55 
 
 
321 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.63 
 
 
319 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 
315 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.96 
 
 
318 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.58 
 
 
321 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  33.56 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.73 
 
 
350 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  31.15 
 
 
320 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  36.1 
 
 
328 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  32.33 
 
 
328 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 
308 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  32.65 
 
 
327 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 
310 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  37.57 
 
 
320 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.64 
 
 
319 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  30.21 
 
 
301 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  27.36 
 
 
351 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  31.19 
 
 
314 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  36.17 
 
 
330 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  36.17 
 
 
330 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.72 
 
 
318 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  32.62 
 
 
374 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.62 
 
 
374 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  37.95 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  27.53 
 
 
326 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  34.77 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.64 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  37.5 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 
314 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  30.35 
 
 
324 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 
320 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  31.99 
 
 
332 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.38 
 
 
327 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.67 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  30.99 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  28.35 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  27.27 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  31.94 
 
 
321 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
365 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  29.13 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  31.44 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  29.05 
 
 
322 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  31.29 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.54 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  37.74 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  34.64 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  30.52 
 
 
318 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.35 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 
311 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  31.21 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  31.21 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.96 
 
 
333 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  25.31 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  34.12 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  36.76 
 
 
312 aa  92.8  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.755034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>