More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2623 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 329 aa  648    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  67.67 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  65.26 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  34.67 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  38.17 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  36.13 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  36.91 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  35.13 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32.18 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.5 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.9 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  32.6 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  32.6 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  33.33 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.65 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.01 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.6 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.39 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  31.9 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  31.07 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.76 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.16 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.5 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  41.18 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.66 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  34.57 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  32.72 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.63 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  34.81 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.55 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  28.35 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.84 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  30.37 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.29 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.81 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.15 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  32.63 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  28.16 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  27.74 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  34.33 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  26.48 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.82 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.78 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.32 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.2 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.06 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.1 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.93 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.69 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  31.52 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  38.46 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  33.63 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  29.94 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  30.09 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  30.07 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  31.25 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  33.13 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.65 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  22.78 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  30.42 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  27.56 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  29.52 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  28.61 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  32.65 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  29.08 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  31.82 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30.67 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  26.61 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  26.61 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  29.84 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.33 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  27.62 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  34.74 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.32 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  31.07 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  27.58 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.95 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  28.18 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  35.96 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  34.2 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>