More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3602 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  100 
 
 		 320 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  51.29 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  38.34 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  38.82 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  36.99 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  36.68 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  33.33 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  36.7 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  32.35 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  34.08 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  38.59 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.88 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  34.25 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  36.42 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  35.31 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  35.86 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  33.45 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  33.01 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  31.37 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  33.11 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  34.39 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.01 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  32.44 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  32.24 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  32.11 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.43 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  32.59 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.49 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  31.48 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  31.48 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  31.48 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  33.44 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  31.17 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.73 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  33.54 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  30.84 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  30.82 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  35.35 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.78 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  30.03 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  29.74 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.46 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.01 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  31.07 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  33.66 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  32.92 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.07 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.63 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  32.69 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  28.09 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  31.71 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  30.09 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.89 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.95 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  28.01 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.04 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.97 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  29.11 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  30.94 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  31.72 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  31.07 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.46 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  30.12 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  34.49 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.52 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.58 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  30.25 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  29.23 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.39 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.93 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.48 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  30.31 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  31.23 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>