More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1521 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  100 
 
 		 336 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.36 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  31.35 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.33 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.78 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  31.94 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  28.4 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  28.16 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.4 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  28.8 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  28.37 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  27.67 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  26.52 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.23 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  29.94 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.21 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  27.81 
 
 		 331 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  28.7 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  26.48 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  28.97 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  27.41 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  28.83 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  26.91 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  28.4 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  28.53 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  25.47 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  28.66 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  27.5 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  35.27 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  35.38 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  27.16 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.32 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.5 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  25.3 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  25.8 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  34.33 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  32.04 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.76 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  27.89 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  27.38 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  26.13 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  26.51 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  36.59 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  27.68 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  27.24 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  26.57 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  26.95 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  28.83 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  31.75 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  28.05 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  27.98 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  25.15 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  27.97 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  27.33 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  24.05 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  28.72 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  26.15 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  28.7 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  27.25 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  27.65 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  29.1 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  26.96 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.61 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  26.46 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  27.69 
 
 		 328 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  30.43 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  27.63 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  31.07 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  26.63 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.02 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  28.53 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  27.19 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  25.94 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  32.87 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  26.52 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  25.33 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  26.49 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  27.67 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  26.87 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  33.65 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  25.68 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  26.59 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  26.55 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  25.79 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  27.08 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>