More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2872 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  100 
 
 
331 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  82.78 
 
 
331 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  54.04 
 
 
335 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  53.58 
 
 
335 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  53.89 
 
 
335 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  54.84 
 
 
336 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  49.85 
 
 
342 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  50.62 
 
 
333 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  49.55 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  53.38 
 
 
277 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.91 
 
 
327 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.31 
 
 
357 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  33.03 
 
 
320 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.13 
 
 
328 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.82 
 
 
320 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  34.08 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.07 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.66 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.01 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  39.25 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  32.79 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 
324 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.22 
 
 
320 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  35.62 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.35 
 
 
345 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  32.13 
 
 
318 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  32.57 
 
 
331 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 
317 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 
325 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  32.19 
 
 
326 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.69 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  28.44 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.23 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  37.26 
 
 
274 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.65 
 
 
330 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 
339 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.07 
 
 
329 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  32.83 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.33 
 
 
327 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.42 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  23.91 
 
 
350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  31.79 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.99 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  29.03 
 
 
319 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  36.5 
 
 
283 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  34.34 
 
 
328 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31.06 
 
 
327 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.52 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 
318 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 
322 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.95 
 
 
368 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 
321 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  31.05 
 
 
320 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  30.82 
 
 
338 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.45 
 
 
351 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.24 
 
 
319 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 
444 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.89 
 
 
317 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 
348 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  33.87 
 
 
318 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  32.15 
 
 
334 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  31.51 
 
 
322 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.35 
 
 
327 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.01 
 
 
383 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 
359 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  26.5 
 
 
319 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.77 
 
 
315 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.11 
 
 
328 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  37.31 
 
 
319 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  33.74 
 
 
440 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.76 
 
 
316 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 
320 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.12 
 
 
334 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  33.23 
 
 
331 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 
324 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  29.01 
 
 
321 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  27.59 
 
 
320 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  29.73 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 
316 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  38.56 
 
 
333 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.67 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  28.17 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  28.93 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  25.88 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.1 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  26.73 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  30.32 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  25.86 
 
 
315 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  27.38 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>