More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4378 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  100 
 
 		 321 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  63.35 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  63.93 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  65.89 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  63.99 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  62.42 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  63.28 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  51.57 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  35.06 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  33.12 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  35.05 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.7 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  34.39 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.13 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  35.46 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  30.54 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.68 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.32 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.22 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  33.55 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.63 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.27 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.63 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.18 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  31.91 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.81 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.43 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.15 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  31.34 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  26.73 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  27.83 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  26.99 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.76 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.77 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.77 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  32.21 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  33.86 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.09 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  25.66 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.84 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.67 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  27.96 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.2 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  30.86 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.61 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  32 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  28.4 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  30.28 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  30.71 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  30.52 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  28.52 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  29.33 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  26.54 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  35.55 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.18 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  29.25 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  26.57 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  33.18 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  28.43 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  29.15 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  29.33 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  28.53 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  25.82 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  27.63 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  31.18 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  31.82 
 
 		 280 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  27.63 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  28.35 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  29.66 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.7 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  28.32 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  29.23 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31.73 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  30.63 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  28.5 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  27.42 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.95 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  28.43 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  31.16 
 
 		 268 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  27.22 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 332 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>