More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1977 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  100 
 
 		 334 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  47.34 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  49.68 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  47.22 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  44.01 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  38.79 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  34.13 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  35.69 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  36.66 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  36.98 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  36.22 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  36.01 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  34.25 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  34.89 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.87 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  34.85 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  33.87 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  34.88 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  34.57 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  34.01 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  35.84 
 
 		 331 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  33.94 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  34.35 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.39 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  32.02 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.93 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  33.74 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.11 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30.82 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.75 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  33.73 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  33.43 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.83 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.03 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.87 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  34.88 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  28.44 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  32.68 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  34.39 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.74 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.74 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  35.74 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.73 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  30.67 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  30.27 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.88 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  30.72 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  30.28 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  28.91 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.78 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  38.05 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  28.13 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.68 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.97 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.59 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.38 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  28.3 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  29.97 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  29.29 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.61 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.2 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  29.78 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  29.97 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.51 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.44 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  28.35 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  27.19 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  31.06 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  36 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  28.7 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  31.4 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  31.73 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  27.79 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  29.69 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  25.45 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  27.95 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.8 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>