More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0724 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  100 
 
 		 330 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  52.32 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  36.22 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.51 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  35.1 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  37.54 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  35.4 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.33 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  34.97 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  31.76 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.57 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.78 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.04 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.27 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.58 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  31.23 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.57 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.15 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.33 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29.08 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.09 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  29.08 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  32.55 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  29.02 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  29.75 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  32.15 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  30.38 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  30.42 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.35 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  33.13 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  31.29 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  28.71 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.43 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  32.15 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  29.45 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  29.69 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.9 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  31.46 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  28.47 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  32.9 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  33.84 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  31.44 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.49 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  37.89 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  33.03 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  32.29 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  29.57 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  25.61 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.82 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  29.15 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  29.1 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  31.46 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  28.67 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  27.7 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  28.67 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  38.73 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.05 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  27.89 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  30.63 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.66 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  28.67 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  28.67 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.25 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  32.3 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  28.16 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  29.82 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  31.37 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  26.67 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  30.46 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  27.54 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.57 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  28.53 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  30.92 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  31.17 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  35.12 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>