More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1285 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  82.06 
 
 		 321 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  65.89 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  60.47 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  62.13 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  61.46 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  60.8 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  55.78 
 
 		 338 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  35.87 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  34.07 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  35.05 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  34.53 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  38.64 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.45 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  33.01 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  35.93 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  34.55 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  35.57 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.78 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  31.42 
 
 		 327 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  34.8 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.25 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  33.45 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  34.45 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.55 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  34.98 
 
 		 325 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  34.64 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.68 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.73 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  32.53 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  33.44 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.35 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  32.37 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.1 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.84 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.59 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  26.09 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.55 
 
 		 320 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  33.11 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.28 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.38 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.67 
 
 		 374 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.17 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  31.69 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 374 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.81 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.37 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  30.21 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  30.21 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  29.37 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  30.87 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  30.32 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  33.08 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  28.92 
 
 		 368 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  27.55 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.16 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.29 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  32.39 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  32.33 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  29.7 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  34.26 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  31.06 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.03 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  33.16 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  28.62 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 335 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  32.71 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.51 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.53 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  27.55 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  32.21 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  28.03 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  31.31 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  31.79 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  34.27 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  28.09 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>