More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0884 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  100 
 
 		 318 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  46.92 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  38.64 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  35.37 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  37.74 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  33.23 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  35.03 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  37.06 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  35.46 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  37.34 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  36.57 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  34.37 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  38.73 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  34.3 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.46 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  36.59 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  38.1 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  37 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  33.75 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  37.34 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  33.55 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  40.67 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  33.44 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.88 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.54 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  34.15 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.61 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  37.29 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  35.42 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  36.18 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.65 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  35.55 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  35.17 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  35.33 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  35.33 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  37 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.22 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.02 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.31 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  32.5 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  35.35 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  29.73 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  32.92 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  35.37 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  37.38 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.8 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  34.03 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.65 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.92 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.08 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  35.27 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.11 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  31.35 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.74 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  35.71 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  33.22 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.66 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.35 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  35.31 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  34.59 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  34 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.13 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  34.19 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.89 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.37 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  38.99 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.84 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  25.95 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.05 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  31.6 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.43 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  31.66 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36.89 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  36.89 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.38 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  30.99 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  30.51 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  35.74 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  29.23 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  31.25 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  34.62 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  30.3 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>