281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2218 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  100 
 
 		 322 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  43.03 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  37.81 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  39.81 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  39.16 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  37.07 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  35.03 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  35.28 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  34.69 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  33.23 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  32.41 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  32.3 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.16 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.56 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.63 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.9 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.44 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  32.68 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  35.81 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.88 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  29.19 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  25.78 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  31.32 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  29.17 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  25.86 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.34 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  26.37 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  30.71 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.23 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.03 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.09 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  27.16 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  27.9 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  33.02 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 		 313 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  32.04 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  27.18 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  26.89 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  28.75 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  27 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.43 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  25.23 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  27 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  28.67 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  29.33 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.01 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  26.23 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  25.39 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  32.24 
 
 		 274 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  23.25 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.21 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  31.23 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  26.21 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  27.58 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  30.3 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  28.31 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  27.92 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.8 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 		 374 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  30.33 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.4 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  30.33 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  24.77 
 
 		 351 aa  85.9  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  27.24 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  30.33 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  23.36 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  25.71 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  27.78 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  25.32 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  26.63 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.41 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  26.97 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  26.47 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  30.97 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  23.78 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  28.4 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  25.4 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  26.87 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  28.15 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.91 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  27.03 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  27.3 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>