More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0922 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 318 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  45.63 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.77 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.22 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.62 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  35.25 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  31.63 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32.53 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.66 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.3 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  29.43 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.61 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  37 
 
 		 344 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  32.88 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.1 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  28.36 
 
 		 373 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.03 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  29.14 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  29.27 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  27.99 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.1 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.88 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  29.18 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  29.76 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  29.34 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  28.67 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  27.59 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  30.99 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.46 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  37.36 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  31.21 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.62 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.09 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  30.89 
 
 		 340 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  35.07 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  29.47 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  25.67 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  34.36 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  32.65 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  27.44 
 
 		 329 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.39 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  32.83 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  27.6 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  27.04 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  30.39 
 
 		 277 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.26 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  26.09 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.49 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  28.48 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  32.43 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  28.52 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.24 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 335 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  26.48 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  27.4 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  26.3 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.11 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.66 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.19 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.04 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 359 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.21 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  27.73 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  30.96 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  28.9 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.15 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2382  regulatory protein PupR, putative  31.63 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  25.15 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  30.85 
 
 		 283 aa  85.9  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  32.51 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  26.43 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  26.75 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.13 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1491  anti-FecI sigma factor, FecR  29.52 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  30.56 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>