More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2125 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 333 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  35.22 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  35.22 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  31.5 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  32.6 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  30.7 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  33.12 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  37.32 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  32.55 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.33 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  36.67 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.79 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.24 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.11 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  31.4 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  35.38 
 
 		 280 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.31 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  28.67 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  34.43 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.13 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  41.72 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.54 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  29.87 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  28.12 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.41 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.41 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  36.41 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  28.43 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.63 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  30.91 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  39.49 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  39.49 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.86 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  33.33 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.79 
 
 		 316 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  37.11 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.99 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  36.04 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.18 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.62 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.86 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.73 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.29 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  35.64 
 
 		 277 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  34.91 
 
 		 283 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.94 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  33.09 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  34.28 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  26.6 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  33.09 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  38.1 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  30.52 
 
 		 402 aa  89.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  33.85 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  36.05 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  26.15 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  32.71 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  33.56 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  25.14 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.75 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  29.18 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  29.79 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  32.16 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.16 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  35.44 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  28.61 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  29.82 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  31.92 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.32 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.29 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  37.37 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  31.37 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>