More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2727 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 325 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  42.51 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.18 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  37.42 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.22 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  31.08 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  34.07 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  31.83 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.01 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.37 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.11 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.22 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  31.39 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.36 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  28.66 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  35.65 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  27.85 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  35.19 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.54 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.05 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.22 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  32.69 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.3 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.7 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1107  putative FecR  33.87 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  34.49 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.32 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  32.7 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  30.94 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  29.26 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  37.8 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30.77 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  34.95 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  25.82 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.96 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  27.3 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  36.97 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  32.09 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  33.81 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.71 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  31.49 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  37 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  31.89 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32.63 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  33.5 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  32.8 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  34.29 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  28.36 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  28.39 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.47 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.79 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.49 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  32.52 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  29.87 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  38.21 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.75 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.35 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  30.6 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  36.62 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.55 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.27 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  27.92 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.61 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  32.59 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.61 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.94 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  29.78 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.97 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  35.59 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  28.83 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  27.83 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  29.55 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  30.42 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.32 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  33.49 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30.55 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  30.18 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>