More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2244 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 333 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  43.87 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  34.57 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  36.3 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  36.36 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.92 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.82 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  36.21 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  39.27 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.49 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  34.41 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  38.28 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.85 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  29.45 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  33.83 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  34.34 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.16 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  39.8 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  27.03 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  29.45 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  34.22 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.73 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  37.32 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.62 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  29.37 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  34.33 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  27.02 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  37.8 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  33.33 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  35.14 
 
 		 336 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  30.46 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  27.86 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  30.53 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  29.66 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.12 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  33.01 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  26.53 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  35.45 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  31.23 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.93 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.76 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  27.73 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  28.48 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  30.43 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  31.27 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  29.76 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  31.42 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  33.55 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  30.9 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  30.9 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  27.25 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  30.9 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  31.83 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.17 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  29.53 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  32.76 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.35 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  31.93 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  35.33 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.01 
 
 		 274 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  30.96 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  28.67 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.91 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  27.78 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  29.27 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  23.24 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  29.75 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  30.03 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  28.66 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  36.46 
 
 		 314 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.7 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  30.77 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  26.73 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.06 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  36.17 
 
 		 320 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  33.2 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>