More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2017 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
345 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  34.26 
 
 
327 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  35.33 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  34.53 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  34.94 
 
 
320 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  36 
 
 
357 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  36.79 
 
 
325 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.99 
 
 
327 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  28.57 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.01 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  34.24 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  31.71 
 
 
342 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.46 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  34.08 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30.84 
 
 
331 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  31.4 
 
 
351 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 
318 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  33.53 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  34.77 
 
 
328 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  35.17 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  31.98 
 
 
331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 
321 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  33.43 
 
 
347 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.24 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  29.12 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  28.35 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.34 
 
 
335 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  28.44 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  36.97 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.47 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.03 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.63 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  35.78 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.96 
 
 
350 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.73 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  33.68 
 
 
377 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 
317 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.79 
 
 
316 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.2 
 
 
317 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.76 
 
 
329 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  28.88 
 
 
319 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  34.46 
 
 
331 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  33.77 
 
 
277 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  32.48 
 
 
327 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.38 
 
 
320 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  35.68 
 
 
283 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 
320 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.56 
 
 
328 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  32.16 
 
 
342 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.33 
 
 
334 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 
307 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.99 
 
 
309 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.72 
 
 
324 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 
342 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.08 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.39 
 
 
306 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  35.78 
 
 
444 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.81 
 
 
314 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.56 
 
 
330 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 
374 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.75 
 
 
374 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  22.44 
 
 
324 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32.28 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.78 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  25.36 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 
374 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.04 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.62 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  29.39 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.84 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.23 
 
 
328 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  26.63 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.5 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  28.4 
 
 
318 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.93 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  31.05 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.41 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  35.22 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  30.52 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  29.84 
 
 
340 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  35.86 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  25.23 
 
 
319 aa  92.8  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  28.85 
 
 
327 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.44 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  31.51 
 
 
318 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  23.3 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  32.55 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  30.88 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  28.44 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>