More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1119 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  100 
 
 		 357 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  45.43 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  44.25 
 
 		 320 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  43.07 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  42.18 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  42.77 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  34.84 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  34.01 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  34.32 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  32.47 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  35.83 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  33.73 
 
 		 335 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  35.31 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  33.14 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  33.43 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  39.09 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  34.43 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  36.23 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  31.5 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  30.79 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.86 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  34.58 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.42 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.38 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.54 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.02 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.33 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.86 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  33.33 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  38.89 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  32.74 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  38.74 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  35.71 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  32.18 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.82 
 
 		 268 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.35 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.04 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  31.66 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.5 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.42 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.61 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  26.76 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.21 
 
 		 318 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.95 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.72 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.87 
 
 		 264 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  32.35 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  28.13 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.88 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  33.33 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  28.78 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.64 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  33.43 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  38.12 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  31.91 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.44 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.43 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  31.09 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  28.24 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.3 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.53 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  34.19 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  34.98 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.14 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  33.23 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  32.43 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  27.95 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.21 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  35.55 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  30.86 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  31.06 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  33.23 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.28 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  35.05 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.65 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  31.75 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  32.11 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  34.91 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  25 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  30.15 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  27.54 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  36.09 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  28.82 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  31.61 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  34.77 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  37.11 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.46 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  33.2 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  29.48 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>