More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2564 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  100 
 
 		 333 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  60.36 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  55.69 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  59.47 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  59.47 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  55.81 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  60.47 
 
 		 336 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  50 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  50 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  49.64 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.33 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  29.48 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.75 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31.73 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  29.52 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  35.81 
 
 		 268 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.73 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  30.47 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.25 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  31.6 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  35.35 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  30.91 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31.48 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  28.05 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.99 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  27.48 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  26.73 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  31.82 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  25.78 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.43 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.7 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  34.15 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.23 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.27 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  27.68 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  27.78 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  23.82 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  28.52 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  27.6 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  29.18 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  30.25 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  30.53 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  26.52 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  29.95 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  27.33 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  27.76 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  26.15 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  25.89 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  29.22 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  26.96 
 
 		 377 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.19 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.13 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  24.92 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  26.49 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  28.99 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  26.95 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  28.76 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  27.15 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  24.5 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  29.43 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  24.1 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  24.92 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  26.54 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.92 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  26.27 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  25.61 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  28.39 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  25.7 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  28.72 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  27.85 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  25.99 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>