More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 280 aa  550  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  86.19 
 
 		 268 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  45.35 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  42.59 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  41.31 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  38.91 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.4 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  41.87 
 
 		 320 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  41.38 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  41.38 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  36.99 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  37.27 
 
 		 357 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  36.94 
 
 		 342 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  36.07 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  40.29 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  36.65 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 		 336 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  39.91 
 
 		 327 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  39.13 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.06 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  35.48 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  33.78 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  39.48 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  37.87 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  30.88 
 
 		 351 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  35.18 
 
 		 324 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  33.83 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 375 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.29 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  37.32 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  35.11 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  36.36 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.57 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.92 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  36.41 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  35.35 
 
 		 324 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  34.96 
 
 		 345 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.77 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  36.04 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  32.22 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  30 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  31.75 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  40.61 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  36.95 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  36.98 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.66 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  35.38 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  33.98 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  32.55 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  34.72 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.11 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.51 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  29.91 
 
 		 396 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  35.41 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  34.11 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.47 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  34.7 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  34.87 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.38 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.3 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  34.41 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  33.15 
 
 		 329 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 359 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  32.63 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  34.29 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  33.71 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  35.02 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  26.15 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  36 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.01 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  35.34 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  35.34 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.5 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  28.85 
 
 		 348 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  38.01 
 
 		 317 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  33.05 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  35.29 
 
 		 350 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  33.5 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  32.25 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  32.25 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  35 
 
 		 329 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  35.35 
 
 		 334 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.34 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  36.13 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  34.9 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  29.59 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  32.47 
 
 		 334 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  35.03 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>