More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  100 
 
 		 277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  50 
 
 		 333 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  51.99 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  52.71 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  48.42 
 
 		 342 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  48.78 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  54.09 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  52.86 
 
 		 336 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  51.99 
 
 		 335 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  51.6 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  36.43 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  36.97 
 
 		 357 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.94 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  34.16 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  33.82 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  37.09 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  38.42 
 
 		 336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.36 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.36 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  36.92 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  32.27 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.23 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  34.18 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  33.92 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  35.78 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.74 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  36.53 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  35.86 
 
 		 334 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  35.29 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  31.05 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  34.48 
 
 		 338 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  34.03 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  35.18 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.69 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  31.37 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  31.27 
 
 		 328 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.39 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.09 
 
 		 319 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.95 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.8 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  34.01 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  36.32 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 314 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  35.64 
 
 		 333 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.57 
 
 		 350 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 384 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 320 aa  92  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  35.26 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  34.36 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  37.57 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  35.42 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  35.23 
 
 		 389 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.71 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  28.86 
 
 		 379 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  32.61 
 
 		 378 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  33.89 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  33.51 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  36.42 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  31.02 
 
 		 398 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  32.62 
 
 		 391 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  32.41 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  28.72 
 
 		 384 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  30.63 
 
 		 345 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  37.87 
 
 		 411 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  32.4 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 398 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  29.73 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  27.7 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  31.41 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.47 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  33.52 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  34.52 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.82 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  32.16 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  31.12 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.87 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  32.39 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  28.38 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  30.81 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  28.52 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  31.53 
 
 		 383 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  29.06 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>