More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0955 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  100 
 
 
383 aa  789    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  42.53 
 
 
391 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  43.3 
 
 
378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  41.43 
 
 
394 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  44.05 
 
 
383 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  40.46 
 
 
388 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  44.02 
 
 
389 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  41.15 
 
 
375 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  41.51 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  48.68 
 
 
376 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  41.21 
 
 
398 aa  275  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  46.35 
 
 
405 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  41.09 
 
 
408 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  46.6 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  39.5 
 
 
398 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  41.77 
 
 
378 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  43.46 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  41.84 
 
 
375 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  38.15 
 
 
390 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  46.82 
 
 
398 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  47.94 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  38.46 
 
 
383 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  40.26 
 
 
386 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  38.85 
 
 
394 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  38.11 
 
 
383 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  39.39 
 
 
394 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  43 
 
 
378 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  36.65 
 
 
408 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  37.4 
 
 
389 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  37.44 
 
 
377 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  37.76 
 
 
382 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  47.19 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  37.91 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 
377 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  36.32 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  38.34 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 
413 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  34.39 
 
 
396 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 
354 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  38.76 
 
 
367 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  36.88 
 
 
381 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  41.24 
 
 
380 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  36.63 
 
 
389 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  38.92 
 
 
390 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  38.12 
 
 
386 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  34.91 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  43.66 
 
 
394 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  36.9 
 
 
385 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  45.38 
 
 
390 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  36.68 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  34.09 
 
 
430 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  36.6 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  36.57 
 
 
385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  40.34 
 
 
384 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  34.18 
 
 
378 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  36.47 
 
 
402 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 
398 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  35.24 
 
 
408 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  33.06 
 
 
424 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  35.2 
 
 
379 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  43.89 
 
 
273 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  35.15 
 
 
412 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  31.89 
 
 
371 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 
386 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 
383 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 
392 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  30.27 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  36.15 
 
 
367 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  31.87 
 
 
381 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 
407 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  30.63 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  28.84 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  35.59 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 
376 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  29.03 
 
 
361 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  34.22 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 
308 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  26.23 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 
379 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  29.19 
 
 
380 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  25.52 
 
 
334 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  34.25 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  36.31 
 
 
332 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  29.33 
 
 
344 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 
351 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  35.26 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 
365 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.47 
 
 
313 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  27.6 
 
 
335 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  30.59 
 
 
374 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 
328 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  23.92 
 
 
342 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.93 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 
315 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  33.12 
 
 
329 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0049  anti-FecI sigma factor, FecR  27.62 
 
 
316 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>