More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1120 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  100 
 
 
382 aa  787    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  42.75 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  42.97 
 
 
386 aa  292  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  44.03 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  41.33 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  43.63 
 
 
375 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  39.74 
 
 
383 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  37.5 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  40.48 
 
 
386 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  42.75 
 
 
388 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  50.55 
 
 
390 aa  268  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  39.6 
 
 
394 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  46.6 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  45.33 
 
 
405 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  40.51 
 
 
378 aa  262  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  37.7 
 
 
383 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  41.32 
 
 
394 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  38.9 
 
 
389 aa  255  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  38.5 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  38.9 
 
 
413 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  40.54 
 
 
396 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  38.07 
 
 
381 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  39.62 
 
 
398 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  37.03 
 
 
394 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  43.92 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  36.52 
 
 
408 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  41.1 
 
 
396 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  40.85 
 
 
397 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  39.32 
 
 
375 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  40.95 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  36.6 
 
 
354 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  38.37 
 
 
389 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  42.42 
 
 
377 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  41.43 
 
 
397 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  37.37 
 
 
390 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  36.06 
 
 
430 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  37.19 
 
 
391 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  35.85 
 
 
390 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  36.95 
 
 
382 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  38.4 
 
 
367 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  37.19 
 
 
394 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  37.01 
 
 
378 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  41.67 
 
 
398 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  35.7 
 
 
408 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  35.93 
 
 
387 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  37.78 
 
 
373 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  35.84 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  37.19 
 
 
384 aa  212  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  42.24 
 
 
385 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  35.68 
 
 
371 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  40.53 
 
 
378 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  42.01 
 
 
392 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  36.83 
 
 
385 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  38.87 
 
 
402 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  40.55 
 
 
385 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  33.68 
 
 
379 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  35.47 
 
 
380 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  34.29 
 
 
408 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  42.39 
 
 
273 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  31.99 
 
 
424 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  29.57 
 
 
371 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 
392 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  30.24 
 
 
367 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  28.91 
 
 
412 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 
386 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.26 
 
 
383 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
383 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  34.11 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  29.73 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  32.32 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  30.97 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 
379 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 
376 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  34.42 
 
 
407 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  27.32 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  31.86 
 
 
411 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  33.08 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  24.18 
 
 
315 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  27.47 
 
 
361 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 
382 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  34.44 
 
 
323 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  31.58 
 
 
332 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  30.68 
 
 
374 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  38.51 
 
 
351 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  30.69 
 
 
329 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  27.7 
 
 
321 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 
328 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 
332 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 
313 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  38.26 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  32.4 
 
 
308 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  31.49 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 
282 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  36.77 
 
 
331 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  26.06 
 
 
345 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3806  anti-FecI sigma factor, FecR  39.31 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 
335 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>