More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0709 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  100 
 
 
398 aa  817    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  45.76 
 
 
394 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  43.21 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  51.58 
 
 
391 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  43.14 
 
 
383 aa  299  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  43.29 
 
 
375 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  44.03 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  44.31 
 
 
388 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  39.51 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  50.18 
 
 
378 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  47.22 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  45.65 
 
 
372 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  41.85 
 
 
392 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  49.28 
 
 
373 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  40.4 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  40.29 
 
 
378 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  46.82 
 
 
383 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  40.49 
 
 
377 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  43.71 
 
 
378 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  44.8 
 
 
394 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  40.19 
 
 
408 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  38.43 
 
 
408 aa  255  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  49.65 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  42.22 
 
 
402 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  49.11 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  42.26 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  43.38 
 
 
385 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  42.75 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  38.83 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  37.71 
 
 
389 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  36.57 
 
 
430 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  42.68 
 
 
354 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  44.59 
 
 
389 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  36.82 
 
 
394 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  38.78 
 
 
398 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  38.89 
 
 
380 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  39.13 
 
 
384 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  36.78 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  37.75 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  36.59 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  39.56 
 
 
386 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  40.05 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  36.72 
 
 
386 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  36.47 
 
 
397 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  43.25 
 
 
387 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 
396 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  42.67 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  34.72 
 
 
397 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  38.76 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  44.01 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  37.6 
 
 
394 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  40.18 
 
 
389 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  49.77 
 
 
273 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  33.25 
 
 
382 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  34.07 
 
 
377 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  35.1 
 
 
381 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  34.38 
 
 
390 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  38.64 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  33.57 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  36.01 
 
 
424 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  34.6 
 
 
412 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 
383 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  38.2 
 
 
386 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  38.15 
 
 
379 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 
385 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  33.64 
 
 
371 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 
383 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.39 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  34.48 
 
 
384 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  35.89 
 
 
374 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  35.14 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  25.37 
 
 
392 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  34.19 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  32.87 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 
411 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  31.28 
 
 
365 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  30.2 
 
 
379 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 
376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.75 
 
 
380 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 
351 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  38.46 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  34.46 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  30.54 
 
 
323 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  33.03 
 
 
345 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  33.91 
 
 
308 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  30.09 
 
 
361 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  35.68 
 
 
316 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  33.71 
 
 
374 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
335 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 
282 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3204  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 
371 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619399  normal  0.25037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.15 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.91 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  33.16 
 
 
347 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  26.98 
 
 
332 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0059  FecR protein  30.37 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  33.16 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 
313 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>