More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4751 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
344 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  35.93 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  38.52 
 
 
375 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  39.13 
 
 
280 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  38.7 
 
 
268 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  34.78 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  34.78 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.87 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  36.09 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.06 
 
 
274 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.17 
 
 
357 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  29.45 
 
 
348 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.2 
 
 
320 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.62 
 
 
342 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  31.5 
 
 
336 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  32.31 
 
 
342 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  29.17 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  30.18 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  31.31 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  35.61 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  34.09 
 
 
277 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  34.98 
 
 
339 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  34.54 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  30.32 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  33.49 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.62 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.49 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.17 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.13 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  29.75 
 
 
317 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.76 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  34.17 
 
 
320 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  27.83 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.19 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30.65 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.72 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  27.59 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.85 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  30.03 
 
 
319 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.51 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 
315 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.56 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.82 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  31.33 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  25.56 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.96 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  29.46 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  31.7 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  25.9 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  28.76 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  31.03 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  27.64 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  28.97 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.39 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.83 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  28.5 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  28.52 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  30.84 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  27.08 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  29.86 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.58 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.95 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  29.86 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  29.86 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.63 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  30.84 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  29.86 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  27.65 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  27.11 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  29.86 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.82 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  32.94 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  27.66 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  32.85 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.81 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  30.38 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  32.17 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  30.85 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 
319 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  31.3 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  27.61 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  25.85 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.16 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>