More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2952 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  41.55 
 
 		 264 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  38.91 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  42.01 
 
 		 274 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  42.61 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  41.56 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  38.56 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  39.25 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  33.49 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  38.6 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  34.25 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  37.38 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.55 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  37.1 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  32.56 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  38.07 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  33.47 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.94 
 
 		 309 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  36.1 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.68 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  34 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  34.2 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.99 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.94 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.32 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  35.22 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.66 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  36.15 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  34.77 
 
 		 444 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  31.22 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  34.63 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  34.98 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.78 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  31.6 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.82 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  28.51 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  36.22 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  35.68 
 
 		 440 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  31.7 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  29.57 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  29.54 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  34.65 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  32.03 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  35.23 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  30.17 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  33.78 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  32.13 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  31.73 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.93 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  33.17 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  35.23 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  36.11 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  35.59 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  35.79 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  34.51 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.65 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  33.2 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  35.79 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  28.25 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  31.22 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.58 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  34.6 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  33.86 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.88 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  30.3 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  36.76 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  35.23 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  28.33 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  31.32 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  32.88 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  34.74 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  32.38 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.03 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  36.27 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  26.56 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  33.81 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.84 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1491  anti-FecI sigma factor, FecR  30.59 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.86 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  34.36 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>