More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3315 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.27 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  35.81 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  32.71 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.58 
 
 		 329 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  35.07 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  29.01 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.63 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.77 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  31.21 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.3 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  32.4 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  35.86 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  36.76 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.72 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  32.5 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.54 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  32.16 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  31.51 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.68 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.32 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  35.66 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.94 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  34.15 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.27 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.85 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  28.73 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  33.8 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.73 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  29.43 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.97 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.7 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  32.54 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31.6 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  27.08 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.25 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.63 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  33.97 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  25 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.05 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.13 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.83 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.32 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  35.24 
 
 		 444 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.48 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.33 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  25.89 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  26.58 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  34.1 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  24.32 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.29 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  28.21 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  22.42 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  28.18 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.6 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  30.17 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  31.82 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  33.85 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  26.55 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.46 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  35.47 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.55 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.61 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  32.12 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.56 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  29.06 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.03 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  28.75 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  32.32 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  26.84 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  30.9 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  26.97 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.69 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  29.93 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  30.23 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  29.55 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  26.53 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  28.57 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  35.8 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  27.85 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>