More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3326 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 444 aa  865    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  43.93 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  37.17 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  37.73 
 
 		 327 aa  120  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  36.28 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  37.44 
 
 		 320 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  35.71 
 
 		 268 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  34.12 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  36.97 
 
 		 357 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  33.97 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  33.07 
 
 		 318 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.7 
 
 		 280 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  35.78 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  29.32 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  32.71 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  27.38 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  38.12 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  27.14 
 
 		 374 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  39.72 
 
 		 329 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.54 
 
 		 350 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  35.08 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  33.33 
 
 		 317 aa  93.6  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.29 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  35.16 
 
 		 316 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  37.99 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.64 
 
 		 342 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  29.66 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  35.71 
 
 		 327 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  33.01 
 
 		 329 aa  89.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  29.22 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.96 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  28.87 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  33.79 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.67 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  26.27 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  33.33 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  37.98 
 
 		 328 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  28.87 
 
 		 318 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  31.43 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  33.53 
 
 		 319 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  34.16 
 
 		 314 aa  86.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.33 
 
 		 317 aa  86.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.98 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.6 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.6 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.41 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  33.9 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.57 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  34.89 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  27.63 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.91 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  27.75 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2317  anti-FecI sigma factor, FecR  37.3 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  33.06 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  35.24 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.45 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.75 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  32.07 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.73 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.92 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  31.28 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  30.86 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  30.04 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  31.34 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  29.03 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.62 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  33.13 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  31.39 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  31.73 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  36.32 
 
 		 318 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  34.12 
 
 		 345 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  29.19 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  28.92 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  29.46 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  31.08 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  35.86 
 
 		 173 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  31.56 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  36.59 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  31.05 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  31.31 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  36.47 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  28.43 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  28.17 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.59 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  30.8 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  32.16 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  30.83 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>