More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4737 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 324 aa  620  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  36.16 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1107  putative FecR  35.22 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.19 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.39 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.83 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  32.47 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.96 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.1 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  36.19 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  34.33 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.31 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  33.66 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.77 
 
 		 368 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  31.97 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  34.75 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  31.15 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  28.66 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  28.08 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  26.14 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  31.41 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.4 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.28 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.34 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.64 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  27.44 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  25.83 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  28.93 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  30.5 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  35.57 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  24.1 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.8 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.23 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.98 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.01 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  31.79 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  30.21 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  32.31 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  29.61 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.99 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  30.93 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  29.94 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  27.22 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  30.36 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  38.38 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  23.28 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.88 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  28.94 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  29.51 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  25.93 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  25.77 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  23.85 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  26.03 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.25 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  36.09 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  37.95 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.78 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  33.99 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  37.85 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  26.13 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.25 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  31.11 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  31.58 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  22.32 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  26.95 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  23.4 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  29.81 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.12 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  29.81 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  33.16 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  24.6 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.55 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  24.91 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  32.6 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  28.3 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  27.39 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.42 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  22.12 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>