More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2144 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 283 aa  552  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  42.59 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  41.83 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  42.11 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  39.31 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  39.82 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  38.35 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  39.13 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  38.12 
 
 		 357 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  36.5 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  36.11 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  36.04 
 
 		 335 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.46 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  34.6 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  34.42 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  36.97 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  33.96 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  35.68 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.13 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  35.78 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.44 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  35.29 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  34.76 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  37.95 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  37.95 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  35.56 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  36.67 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  34.48 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  35.21 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  36.44 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  34.78 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  34.15 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  38.27 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  34.78 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  34.62 
 
 		 375 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  33.16 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  33.16 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 		 326 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  35.38 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  32.24 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.74 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  33.17 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  33.49 
 
 		 337 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.4 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  34.5 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34.55 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  37.44 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  31.98 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  35.96 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  36.87 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  34.78 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  38.62 
 
 		 318 aa  90.1  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.86 
 
 		 374 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  34.86 
 
 		 374 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  37.02 
 
 		 316 aa  89  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.35 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  35.59 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  31.02 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  31.02 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  35.57 
 
 		 374 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  32.65 
 
 		 444 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  35.58 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  35.57 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  32.37 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  33.08 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  37.31 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  32.58 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  37.31 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 320 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  34.52 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  38.22 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  28.78 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  29.12 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  37.85 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2599  putative FecR  32.23 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  29.96 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  35.08 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  34.06 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.83 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  30.3 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.51 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.52 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  30.52 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  33.05 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  34.02 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  34.48 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  34.16 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>