More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1107 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1107  putative FecR  100 
 
 		 311 aa  600  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  43.97 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  37.66 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  34.28 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.43 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  32.75 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.41 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.57 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  34.45 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  32.6 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.27 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  33.07 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.97 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  30.2 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.39 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.97 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 359 aa  85.9  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.64 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.76 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32.62 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  33.62 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  32.27 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.62 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.09 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.09 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  31.48 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  31.43 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.83 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.08 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  26.19 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.78 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  30.53 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.25 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.76 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  38.32 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.71 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  24.24 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  31.44 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  30.42 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.57 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.56 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  32.11 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.25 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  38.6 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.33 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.57 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.39 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.04 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  30.48 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.22 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  29.89 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.29 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.67 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  26.21 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  34.48 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  25.48 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30.68 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.51 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  23.93 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.89 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  32.28 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  34.25 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.18 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.82 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  27.23 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  26.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  27.1 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  27.37 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  38.67 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  24.7 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  27.31 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  30.93 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  34.93 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  29.46 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  26.49 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  36.26 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  32.04 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  25.55 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  33.9 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>