More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4312 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 320 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  80.94 
 
 		 320 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  78.12 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  77.19 
 
 		 320 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  55.31 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  43.07 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  39.87 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  38.36 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  34.26 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  33.73 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  33.12 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.7 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  35.54 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.05 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.87 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  32.57 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  33.01 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  41.87 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  32.4 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  40.78 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  35.57 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  35.43 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  34.87 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.11 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  32.01 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  27 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.57 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  34.3 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  33.9 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  33.53 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  32.05 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  34.39 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.14 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  34.77 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  38.24 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  31.15 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  35.86 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.67 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.73 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  39.74 
 
 		 440 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  35.41 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  35.07 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.6 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  26.44 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  36.36 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  34.66 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  29.6 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  35.59 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.82 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  31.01 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.46 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  38.36 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.02 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  29.84 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.63 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  32.37 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  30.2 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  34.06 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  34.82 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  39.44 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  33.55 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  33.55 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  33.44 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.23 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  33.11 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  32.45 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  33.33 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  33.77 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  30.38 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  31.79 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  33.66 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.07 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  33.44 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.37 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  32.67 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  34.43 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  32.29 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  33.97 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.88 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.24 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  34.78 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  34.08 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>