More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5853 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 375 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.29 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  31.71 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  30.37 
 
 		 327 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.81 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  29.45 
 
 		 350 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  38.52 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  30.56 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.49 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  37.39 
 
 		 440 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.67 
 
 		 268 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  30.43 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.33 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  36.02 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.29 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31.12 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  28.78 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.95 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.53 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  24.18 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.09 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.8 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.87 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  33.01 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.86 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  35.32 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.96 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  29.69 
 
 		 321 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  28.91 
 
 		 350 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.04 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  35.64 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.56 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.65 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  34.62 
 
 		 283 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 		 320 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.7 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  24.5 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  23.26 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  35.27 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 		 336 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.41 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  28.99 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  30.51 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.65 
 
 		 339 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2530  putative FecR  28.74 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.69 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.89 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.5 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  27.73 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.51 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  35.21 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  30.26 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 316 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  31.34 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  31.34 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  31.34 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  31.34 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 342 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  30.26 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  27.68 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  31.34 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.28 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.15 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  28.87 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.85 
 
 		 331 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  29.09 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.39 
 
 		 264 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 320 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  25.14 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  31.1 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  24.15 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 327 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.63 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29 
 
 		 330 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  29.38 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.04 
 
 		 311 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.48 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  31.86 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  33.99 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  29.41 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  33.49 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  29.67 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  35.32 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  33.49 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  29.3 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.25 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>