More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  100 
 
 		 264 aa  507  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  42.53 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  41.43 
 
 		 319 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  41.4 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  40 
 
 		 268 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  40.38 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.73 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  37.25 
 
 		 328 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  40.67 
 
 		 328 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  36.41 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  37.87 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  37.86 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  35.44 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.19 
 
 		 327 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  35.82 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  38.71 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  36.89 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  30.91 
 
 		 396 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  34.7 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.04 
 
 		 374 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  34.04 
 
 		 374 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.9 
 
 		 335 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  34.85 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  41.24 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  36.73 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  36.81 
 
 		 374 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  37.06 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  35.98 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  35.22 
 
 		 330 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  35.22 
 
 		 330 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  33.81 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  33.83 
 
 		 342 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  36.67 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  36.55 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  35.21 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  36.55 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  35.83 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  38.55 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  36.76 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  37.3 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  33.47 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 		 342 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  36 
 
 		 326 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  32.7 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  34.62 
 
 		 344 aa  99  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  36.89 
 
 		 316 aa  98.6  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  35.19 
 
 		 313 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  38 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  34.48 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.64 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  33.33 
 
 		 333 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  36.82 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  36.76 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.83 
 
 		 319 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  33.98 
 
 		 306 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  35.41 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 359 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  37.3 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  34.17 
 
 		 331 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  32.38 
 
 		 330 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  32.13 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  35.26 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.68 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.14 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  37.98 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  33.64 
 
 		 329 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  35.07 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  32.13 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  30.1 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.25 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.24 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  33.68 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  36.67 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  35.23 
 
 		 327 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.77 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  33.62 
 
 		 377 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  33.6 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  31.39 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  35.2 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  36.82 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  29.8 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  32.96 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.07 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  33.66 
 
 		 340 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  32.69 
 
 		 336 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.54 
 
 		 320 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  34.4 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.53 
 
 		 329 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  33.04 
 
 		 327 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  32.68 
 
 		 321 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  32.52 
 
 		 334 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>